在通風不良或經常不透陽光的圈舍，塵埃更促進各類微生物的繁殖，每立方米空氣中細菌達100萬個，豬舍中常見的微生物菌類中，量的黃曲霉菌、毛霉菌和較多的腐生菌、放線菌等。豬的好多病菌，可通過塵埃進行傳播。 塵埃本身對豬的健康也有直接影響。塵埃降落在豬體表面上，形成皮垢，影響皮膚的散發熱量，致使皮膚發癢甚至發炎、干燥、破裂。大量的灰塵落在眼結膜上，會引起結膜炎。塵埃被豬吸入呼吸道，對鼻腔粘膜上，會引起結膜炎。豬e網網友介紹，塵埃被豬吸入呼吸道，對鼻腔粘膜發生機械性刺激。
更為嚴重的是，塵埃上常常有病原微生物，以致傳播豬的各種疾病。 應及時清除豬舍污物，避免塵土飛揚，保持合理的通風換氣或定期進行消毒。
自然界中廣泛地存在著各種微生物，其數量隨空氣濕度、溫度及塵埃的多少而有差異。當豬舍溫度、濕度適宜時，空氣中的塵埃越多，微生物就越多，也就說，這個溫、濕條件下也適宜微生物的每殖和生長，塵埃又是微生物的載體。
