在冬季，如何保護好戶用沼氣池，并使沼氣發酵維持在較好水平，達到較高產氣率，簡單地說，就是要“吃飽肚子，蓋好被子”。具體做好以下幾方面：
增加投料。進入冬季后，沼氣菌分解有機物速度下降，需要加大發酵液的濃度，因此需要比夏季增加投料量。加料時，應選擇晴天進行，濃度可適當提高到10%－15%。以多次少量投料為好，不要一次性投料過多，防止酸化，且保持均衡產氣。
補充原料。入冬前后，原先運行正常的沼氣池，出現產氣明顯下降的現象，排除漏氣因素外，說明原料不足。因此，除了保持日常的新鮮人畜糞入池外，有條件的還要補充干蠶沙或鮮牛糞、鮮羊糞等熱性發酵原料，可以提高池溫、加速分解。干蠶沙、羊糞要用沼液充分浸泡后才能投入，一次投入量不能太多，注意篩出干蠶沙中的石灰。
及時出料。沼液沼渣是很好的有機肥料，冬季一定要及時清出，以保證足夠的貯氣空間。特別是當沼氣池發酵不正常，沼氣表有壓力而用氣不夠等病態池時，一定要及時處理水壓間沼液。在清出沼液的同時，要注意補充進料。
充分攪拌。每隔一星期左右，在晴天中午，用抽渣器上下活動20次左右，或從水壓間提出10桶沼液倒入進料口，使原料和微生物增加接觸機會，促進微生物新陳代謝，還能防止沼氣池內浮渣結殼。
控制冷水。冬季氣溫、水溫偏低，過量冷水入池會導致池內溫度下降太快，影響產氣，甚至不產氣。因此，農戶要采用少沖冷水的辦法，控制衛生間、豬圈過量的冷水過量進入沼氣池內。室外的沼氣池除此之外，還要嚴防雨水、雪水和其它冷水入池。
科學保溫。室外沼氣池必須采取覆蓋保溫。保溫的方式是在沼氣池蓋板上面覆蓋厚厚的稻草、秸稈，而后蓋上厚塑料薄膜覆保溫；也可以在沼氣池蓋板上蓋一層土或堆上堆肥，防止沼氣水壓間結冰，以保護沼氣池和保證正常發酵；室內沼氣池在低溫來臨之際，注意關好門窗，防止池內溫度降幅過大。
檢修管道。入冬前，要檢查管道是否存有積水，如有積水，要及時倒出再接好管道。注意要把輸氣管道埋入地下或者用稻草繩、碎布條、塑料薄膜包扎，防止凍裂。漏氣、老化的管道、接頭要及時更換
